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皖2005j201“X灯实验室”:跨越合成生物学“死亡谷”

收集整理:九站网 更新时间:2024-04-26 06:16 文章来源:每日看点快看

皖2005j201本文转自:文汇报①宗夜晴正在查看“X灯实验室”中的菌株表现。②菌株被送入自动化小试发酵平台进一步培育筛选。③蓝晶微生物在上海总部的实验室面积扩大了两倍,“X灯实

原标题:《“X灯实验室”:跨越合成生物学“死亡谷”》

皖2005j201本文转自:文汇报

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皖2005j201①宗夜晴正在查看“X灯实验室”中的菌株表现。

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皖2005j201②菌株被送入自动化小试发酵平台进一步培育筛选。

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皖2005j201③蓝晶微生物在上海总部的实验室面积扩大了两倍,“X灯实验室”与其他实验器材同处一室。

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皖2005j201④蓝晶微生物是虹口区北科创生物技术产业园首批入驻企业。均本报记者叶辰亮摄合成生物学的最终目的,是将生命科学的原理和突破,转变为技术创新和生产力。从这个角度看,每次菌株实验,都蕴藏着拓宽人类知识边界的契机。

皖2005j201■本报记者单颖文

“明天9点多我去实验室看结果,如果结果不理想,我们再约时间。”蹲点结束前一晚,“宗师兄”发来微信。实验按周排期,但辛苦设计构建出来的菌株,表现不符合期待也是常有的事。

“宗师兄”本名宗夜晴,合成生物企业蓝晶微生物科技有限公司的高级研究员。他主要负责设计自然界中不存在的基因*码、编写基因程序,用新分子和新材料“造”出菌株,供工厂规模化量产塑料替*品——被誉为“绿.se塑料”的可降解生物聚合物PH..A。而他用来筛选优质PH..A菌株最重要的装备,则是“X灯实验室”。所谓“X灯实验室”,是一组自动化实验仪器组,在操作环节可实现全程无人化智慧运行,“不开灯也能做实验”。

去年,蓝晶微生物在上海设立总部,是刚建成的虹口区北科创生物技术产业园首批入驻企业。这里,新的实验室面积是原先的两倍,“X灯实验室”与诸多相关实验设备同处一室,更便于操作;操作的高级研究员,只需“宗师兄”一人即可。

当然,这并不需要“宗师兄”一人打几份工——随着蓝晶微生物迅速发展,压力从研发端转向生产阶段。他要做的是“好上加好”:研发出更具新质生产力特征的PH..A,使其产量更高、稳定X更强、使用原料价格更低。最近一周的实验,就是通过改写原本吃棕榈油的PH..A菌株基因*码,让它们能吃餐厨油、变质油等,且长得更快、产得更多。由此为公司降本增效,也让这家环保企业的绿.se基因成.se更足。

本周实验任务结束,“宗师兄”将与菌株开发团队前往量产PH..A的工厂一线:实验室的一小步,将在工厂量产时成为降本增效的一大步。这也敦促他们不断构建并筛选出更高X能的新菌株,以适应日新月异的产线需求。

贴近产线的“X灯实验室”,成了行业“光照进来”的地方。

“X灯实验室”的意义

让信息化、智能化的“X灯实验室”参与合成生物研发,是蓝晶微生物的创新突破。

屏幕上,交错攀升的线条昭示着本期“X灯实验室”的实验结果:最新合成的能吃餐厨油的新菌株,在生长速度、耐受度、转化率等方面的表现,均优于对照组。

公司研发团队中,生物技术与电子技术团队人数相方,以跨学科合作赋能企业全链条发展。一年多前自主研发的“X灯实验室”,就来自生物学、物理学、自动化设计、机械工程等多领域人才的合作——技术人员将研究员的思路通过编程表达出来,并引入机器人、机器视觉等先进技术,形成流程自动化、过程可视化、操作无人化的高效处理系统。

得益于跨学科合作,“X灯实验室”在投用后不断优化。比如覆盖在细菌培养多孔板上的透气X,如果按传统做法,每次取样都要损耗一张。而高通量实验且高频次取样,成了一笔不小的开销。与研发团队反复讨论、实验后,工程人员开发出一种“透气盖”及配套开盖装置,盖子可在灭菌后重复使用,节省成本还更环保。同时,研究人员的操作界面简单友好。实验室连接的电脑上,通过可视化程序,只需拖动鼠标,就能调整菌株结构、培育时长、实验顺序等;透过曲线图可看到菌株表现。

由于生物实验的误差较大,特别是多孔板发酵这样的小规模实验,必须重复至少3次实验且保持同一结果,才算达标。这也导致了生物实验的大体量。以往,把实验材料和耗材在仪器设备间“腾来挪去”的生物实验,需要实验室时刻有人,且能精准完成每次“挪动”。以生产PH..A的菌株培养、筛选为例,无论靠机器还是人力,一场实验都需要两三天。但自动化实验室的“一开一关”,可以替*10人次的“三班倒”,且不出错,让企业以降本提质的方式开展系统X实验。

宗夜晴说,“X灯实验室”还能无缝衔接菌株从“造出来”到“养出来”再到“挑出来”等环节,提升菌株上产线的效率。同时,优化分配企业研发资源,让研究员把更多时间投入到更有挑战X的研发工作中。

“宗师兄”的炼成

人是生产力中最活跃、最具决定X力量的因素。在蓝晶微生物,与研发“X灯实验室”几乎同步的,还有一个带有创新意义的“人才矩阵”。

在“X灯实验室”助力下,蓝晶微生物也能腾出更多精力培育跨学科人才。粗略统计,从菌株研发、发酵提取工艺开发优化,再到工业量产,PH..A仅在技术端就涉及二级学科20余门。而每次突破X发展,至少需要集合生物、化学、环境、材料4类专业人才,投身研发、工艺、工程、生产4个关键节点。

宗夜晴出生于1987年,博士毕业于中国科学院微生物研究所生物化学与分子生物学专业。2002年起,国内院校开始设立合成生物学相关专业,毕业生规模小且集中,学术背景关联度很高。蓝晶微生物成立于2016年,作为公司创始人“师出同源”的学术伙伴,宗夜晴2019年入职。此次公司扎根上海,大量90后研发人员从北京、深圳等地前来,在以花名示人的蓝晶微生物,宗夜晴自然被大家尊为“师兄”。

当然,能成为“宗师兄”,宗夜晴还有其他过人之处,比如他参与了公司“知识管理团队”的建设。作为一家知识密集型企业,蓝晶微生物有大量专业知识需要沉淀和管理,并被员工学习吸收。为此,公司召集宗夜晴等开发了学习系统BlueUp,不仅海纳学科,还将同一课程细分为多个等级,分别供本专业研究生、其他专业研究生和“小白”学习。来上海后,宗夜晴又承接了“X灯实验室”的员工培训,参与编写了操作X极强的《实验室使用手册》。

“我们都上过他的课,他是大家当之无愧的‘宗师兄’。”公司95后研发人员琉璃说。

工厂的进击

一根蓝晶™PH..A制成的吸管,从落入海水的一刻起,就会引来微生物啃食,第四周便几近消失。每每被问及“蓝晶微生物是做什么的”,公司执行总监张甄杰就用这段小视频“有图有真相”地介绍。

合成生物作为绿.se制造的核心技术,是以物理定理来设计、构建出模拟生物,再通过实验预测生物X能,因而具备高附加值、低环境影响等产业特征。与石油的不可再生相比,人类原创出的PH..A不会产生二次环境污染,而且生产PH..A的原料都是微生物菌种,可以不断被培育生产、优化升级。“X灯实验室”筛选出的RE菌株进入工厂前,还得通过一扇自动门:门的另一侧,是蓝晶微生物的小试实验室,这里将以1∶10的比例优中选优,再将选出的菌株规模化生产。

从Lab(实验室)研发到Fab(工厂)工业量产,被称为合成生物学的“死亡谷”。因为,实验室场景是理想条件下的DBTL(设计—构建—测试—学习)闭环。量产,面对的是复杂综合的工艺放大系统,要担心空气质量等因素对微生物生长的影响,要考虑“三废”的处理压力、能耗指标的限制等等。

去年,蓝晶™PH..A一期工厂当年动工、当年投产,而这一过程在其他国家通常需要5至8年。要走通产品商业化,更需要包括“宗师兄”在内的菌株研发团队走进工厂贴近产线:将菌株实验室研发数据与生产关联,减少技术转移带来的偏差,并将菌株开发、小试、中试到工业量产各环节的数据整合成系统,从宏观层面发现并解决问题。

生物医X是上海重点规划发展的三大先导产业之一。入选2023福布斯中国创新力企业50强的蓝晶微生物,在去年上海全球投资促进大会上作为重大产业项目签约落地。

新一周的安排已出炉。本月底,蓝晶微生物与北科创集团筹建的“天工开物”生物技术产业孵化服务平台将上线,蓝晶微生物办公室将出现“一桌一企业”联合办公场景,小试实验室也将开放给其他科创公司使用。张甄杰介绍,该平台不仅将共享实验设备,还将共享运营管理、驻场科学家以及研究、技术和行业资源,提供成果供给、概念验证、创新孵化等科创服务,以生态创新推动更多生物技术企业突破“从0到1”,并走向“从1到10”。“争取成为培育独角兽的独角兽企业。”

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